爪哇木棉和美丽异木棉的主要区别是:爪哇木棉树干的皮刺随着生长会逐渐脱落、花黄白色花期12-2月、叶全缘或偶于先端具疏锯齿,美丽异木棉树干的刺宿存、花粉红色花期9月至次年1月(5-8月间零星开花)、叶缘有锯齿。