大剂量抗生素不能控制症状者，即应作局部骨钻孔手术，用以引流与减压。引流越早、越彻底，防止感染扩散和缓解症状的效果越好。可于骨洞内放两根塑料管作连续冲洗吸引治疗。近侧放细管，连接输液瓶滴入抗生素溶液。24小时连续滴入1500～2000ml。剂量相当于每日全身用量的1～2倍。远侧放粗管，头端开几个侧孔，尾端连接负压吸引瓶，然后将伤口作整层缝合，开始冲洗与引流。

关节切开引流适用于较深的大关节，穿刺插管难以成功的部位，如髋关节。而关节腔穿刺适用于表浅的大关节，如膝关节。经关节穿刺及关节内注射抗生素治疗仍未能控制症状，或关节闭式冲洗疗效不佳时，应及时作关节切开引流术。

对早期确诊具有重要价值。可在肿胀及压痛最明显处，用较粗的穿刺针先穿入软组织内，如未抽得脓液，再穿至骨膜下，若仍无脓液，则再深入，穿破骨皮质，进入干骺端骨髓内。切勿一次穿入骨内，以免误将单纯软组织感染的细菌带入骨内，人为地导致骨髓感染。若抽得脓液、混浊的渗出液或血性液体时，作涂片检查，见有脓细胞或细菌时，即可确诊，并作细菌培养和药物敏感试验。

化脓性关节炎时，关节液渗出分为3期：浆液渗出期、浆液纤维蛋白渗出期和脓性渗出期，早期关节液浑浊，晚期则为脓性，关节液细胞计数平均为100×10⁹/L，涂片可见大量白细胞和细菌。关节结核的细胞数相对较少，早期为非特异性渗出，涂片可见分枝杆菌。

骨关节结核手术治疗的目的是为了清除病灶，缩短疗程，提高治愈率，但由于结核手术较大，必须提高病人的手术耐受力，对于主要脏器功能不好或体质差的患者应该先行内科治疗以提高手术的成功率。